Strange Dawn (2000)

Yuko and Eri are two normal girls who are sucked into the alternate world filled with tiny people. The people of this mysterious world sees them as their "Great Protectors" who can protect their land in a time of strife. The two girls set out on a mission with a group of warriors from the village to find out how they were brought here and how might they return home. However, there is a war brewing and these two Great Protectors are the political tool that every faction lusts for to rally the people to their side.
Annotation:
It seems that the complete series aired on Channel 5 (UK), but only 7 episodes have been released on DVD in the US.

Source: www.anisearch.com/anime/1793

Yuko und Eri sind zwei ganz normale Mädchen. Eines Tages werden sie plötzlich in eine andere Welt gesogen, in der es nur kleine Wesen gibt. Diese Wesen sehen die beiden als deren »Beschützer«, die ihre Welt in der schlimmen Zeit der Unruhen beschützen. Die beiden Mädchen werden mit einer Gruppe von Kriegern aus dem Dorf losgeschickt um herauszufinden, wer sie in diese Welt gebracht hat und wie sie wohl wieder in ihre Welt zurückkehren könnten. Zur Zeit wütet aber ein Krieg in der Welt der »Kleinen« und unsere beiden Mädchen merken schnell, dass sie für beide Seiten ein politisches Werkzeug darstellen. Jede Fraktion versucht die beiden für ihre Sache zu benutzen, um so wiederum möglichst viele Leute für ihre Seite zu gewinnen.

Quelle: www.anisearch.de/anime/1793